【支援800件・採択率80%】中小企業は補助金を複数同時に使える？併用OKとNGのルールを整理

# 補助金の併用で中小企業が資金調達を最大化する方法【2026年最新】

2026年最新情報に対応。補助金HACKが新制度への即時対応情報を随時更新中です。

業種を問わず中小企業経営者から「補助金は1社1つしか使えないのか？」という質問をよくいただきます。事業承継後に設備刷新や生産ラインのDX化を進めたい二代目社長の方からも、同様のご相談が増えています。

結論からお伝えすると、補助金の併用パターン・組み合わせを正しく理解すれば、複数の補助金を同時に活用できます。ただし「同じ経費に2つの補助金を重ねる」ことは禁止されており、ルールを知らずに申請すると採択取消になるリスクもあります。

本記事は、補助金HACKの申請支援現場での知見（申請支援実績800件・採択率80%（支援実績に基づく推計値））をもとに、補助金の併用ルール・OKパターンとNGパターン・申請順序の考え方・よくある失敗まで、中小企業経営者の方に向けてわかりやすく整理しました。

「設備投資とDX化を同時に進めたい」「持続化補助金ともの補助金を一緒に使えないか」と考えている経営者の方は、ぜひ最後までお読みください。

「自社に使える補助金の組み合わせを知りたい」という経営者の方は、まずLINEで業種と投資内容をお知らせください。通常24時間以内に診断結果をお届けします。

補助金の「併用」とは何か？中小企業が知っておくべき基本ルール

補助金の「併用」とは、1つの会社が複数の補助金や助成金を同時期に受給することを指します。

国や自治体が提供する補助金・助成金の制度は、それぞれ独立した制度として設計されています。そのため、対象となる経費が重複しない限り、複数の制度を組み合わせて活用することは原則として認められています。

たとえば、以下のような組み合わせが考えられます。

• ものづくり補助金（省力化）で生産ラインの設備を導入する
• IT導入補助金（通常枠）で生産管理システムを導入する
• キャリアアップ助成金（厚生労働省）でパート社員の正規雇用転換を行う

それぞれ対象となる経費が異なるため、同時期に申請・受給することは可能です。

補助金とは、審査を通過した事業者に対して国や自治体が支給する返済不要の公的資金です。助成金とは、雇用や賃金に関する要件を満たすことで原則受給できる厚生労働省系の支援金です。両者は制度の仕組みが異なる点を先に押さえておきましょう。

比較項目	補助金	助成金
主な所管	経済産業省・中小企業庁など	厚生労働省
受給の仕組み	審査あり・採択型（落ちることがある）	要件を満たせば原則受給可能
主な用途	設備投資・販路拡大・DX化など	雇用維持・賃金引き上げ・人材育成など

ただし、同一の経費に対して複数の補助金を重ねて申請することは禁止されています。発覚した場合は採択取消・補助金の返還命令を受けます。

まず「併用OKかどうか」は経費の重複があるかどうかで判断する、という基本を押さえておきましょう。

補助金の「同時申請」をH3で確認する

補助金 同時申請では、申請タイミングの重なりだけでなく、受給・事業実施期間の重なりも考慮が必要です。大きく3つの軸で分類できます。

1. 所管省庁が異なる組み合わせ：経産省系と厚労省系の組み合わせは重複が起きにくく、最も安全
2. 対象経費が明確に異なる組み合わせ：設備費とソフトウェア費、広告費と雇用費など
3. 申請タイミングを分けた組み合わせ：年度をまたいで別々の期に申請するケース

補助金HACKの申請支援現場では、「1と2を同時に満たす組み合わせ」が最も採択リスクが低く、管理もしやすいパターンとして推奨しています。

補助金の併用OKパターンとは？具体的な組み合わせ事例

補助金の併用が認められる典型的なパターンは「異なる目的・異なる経費への申請」です。

ここでは、中小企業（特に製造業・飲食業・小売業）でよく使われる併用の組み合わせを具体的に紹介します。

パターン1：ものづくり補助金 × IT導入補助金

製造業で最も多い組み合わせです。

• ものづくり補助金：生産設備の導入（機械装置費）
• IT導入補助金：生産管理システム・在庫管理ソフトの導入（ソフトウェア費）

設備費とシステム費は別の経費区分になるため、両方の補助金を申請できます。

実際の自己負担イメージ（目安）：

• 設備投資1,000万円 → ものづくり補助金（補助率1/2）→ 補助額500万円、自己負担500万円
• システム導入300万円 → IT導入補助金（補助率1/2〜2/3（枠・類型による））→ 補助額150〜200万円、自己負担100〜150万円
• 合計自己負担：約650万円（単独負担の場合1,300万円から約650万円削減）

補助率（補助対象経費に対して支給される割合）や上限額は枠・類型によって異なりますので、公募要領（各補助金の申請条件・対象経費・審査基準などを定めた公式の申請案内書類）でご確認ください。

パターン2：小規模事業者持続化補助金 × 雇用関連助成金

小売業・飲食業・サービス業でよく見られる組み合わせです。

• 小規模事業者持続化補助金：チラシ・ホームページ・看板などの販促費
• キャリアアップ助成金（厚生労働省）：非正規社員の正規雇用転換に伴う助成

持続化補助金は経産省・中小企業庁、キャリアアップ助成金は厚生労働省と所管省庁が異なります。対象経費もまったく別なので、原則として併用可能です。

パターン3：省力化補助金 × 業務改善助成金

人手不足が深刻な製造業・建設業で注目されています。

• 中小企業省力化投資補助金：自動化設備・省人化機器の導入
• 業務改善助成金（厚生労働省）：最低賃金引き上げに取り組む事業場への助成

設備投資と賃金引き上げをセットで進めることで、補助金・助成金の両方を活用できます。

組み合わせ	対象経費（補助金A）	対象経費（補助金B）	主な業種
ものづくり補助金 × IT導入補助金	機械・設備費	ソフトウェア費	製造業
持続化補助金 × キャリアアップ助成金	広告宣伝費	雇用・賃金費用	飲食・小売
省力化補助金 × 業務改善助成金	省力化設備費	賃金引き上げ	製造・建設
IT導入補助金 × 持続化補助金	ITツール費	広告宣伝・店舗改装費	小売・サービス

主要補助金の採択率早見表

補助金ごとの採択率には大きな差があります。複数申請の優先順位を決める際の参考にしてください。

補助金名	採択率の目安	備考
ものづくり補助金	40〜50%程度	公募回・枠により変動（中小企業庁公表値を参照）
IT導入補助金（通常枠）	60〜70%程度	枠・類型により変動
小規模事業者持続化補助金	60〜70%程度	公募回により変動（中小企業庁公表値を参照）
中小企業省力化投資補助金	70〜80%程度	カタログ型のため比較的高め（推定）
事業再構築補助金	30〜40%程度	第10回公募時点の参考値。※現在公募停止中のため、中小企業庁公式サイトで最新状況をご確認ください

※採択率は公募回・申請枠・事業年度により変動します。最新の採択率は各補助金の公式サイトおよび中小企業庁の公表資料でご確認ください。

都道府県独自補助金との組み合わせについて

国の補助金と並行して、都道府県・市区町村が独自に設置する補助金を組み合わせる活用法も増えています。自治体補助金は対象経費・補助率が国の補助金と重複しなければ原則として併用可能です。ただし自治体によって要件が異なるため、申請前に地元の商工会・商工会議所または都道府県の担当窓口に確認することをおすすめします。

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現在の投資計画と使える補助金の組み合わせを比較検討したい方は、LINEでご相談ください。24時間以内に複数パターンの候補をお届けします。

業種別のおすすめ補助金の組み合わせは？

業種によって「相性の良い補助金の組み合わせ」は異なります。

製造業の場合

製造業は「設備投資」「システム導入」「人材確保」の3方向で補助金を活用できます。

• ものづくり補助金（または中小企業省力化投資補助金）：設備の導入・入れ替え
• IT導入補助金：生産管理・在庫管理のシステム導入
• 雇用関連助成金（厚生労働省）：採用・育成コストへの支援

製造業の申請パターンは「既存機械の入れ替え」と「業務効率化のためのシステム導入」の2パターンが大半です。この2パターンは対象経費が分かれるため、複数補助金の活用に向いています。

なお、2026年からは新事業進出補助金・成長加速化補助金など新制度も始まっており、補助金HACKでは即時対応中です。製造業の方は特に、最新情報のご確認をおすすめします。詳細は補助金HACKのLINEにてお知らせしています。

<details> <summary>飲食業の場合（クリックで展開）</summary>

飲食業は設備・広告・人件費と補助対象になりうる経費が多く、補助金を活用しやすい業種の一つです。

• 持続化補助金：メニュー表・チラシ・ホームページ・写真撮影費
• IT導入補助金：POSレジ・予約管理システムの導入
• 業務改善助成金：賃金引き上げに伴う支援

飲食業では「新しいサービスのための機器購入」も補助対象になりうるため、事業の方向性と補助金の目的を合わせて計画を組むのがポイントです。

</details>

<details> <summary>IT・サービス業の場合（クリックで展開）</summary>

IT業界は自社でシステム対応できるケースが多いため、補助金申請件数は少ない傾向があります。ただし事業拡大・採用強化の文脈では以下の組み合わせが活用されています。

• 持続化補助金：外部向けの広告宣伝・Webサイト強化
• キャリアアップ助成金：非正規社員の正規転換
• 人材確保等支援助成金：採用・定着促進への支援

</details>

<details> <summary>個人事業主・小規模事業者の場合（クリックで展開）</summary>

個人事業主だからNGという補助金制度はほぼありません。最も相性が良いのは小規模事業者持続化補助金で、50万円以下の案件については採択されやすい傾向があります（補助金HACKの支援実績に基づく見解）。

</details>

補助金の併用NGパターンとは？やってはいけないケース

補助金の併用NGとなる最大の理由は「同一経費への重複申請」です。

NG例1：同じ機械の購入費に2つの補助金を申請する

300万円の工作機械を購入する際に、ものづくり補助金と省力化補助金の両方に同じ機械を対象として申請するのはNGです。発覚すれば両方の採択が取消になるリスクがあります。

NG例2：採択後に計画外の用途で補助金を流用する

補助金HACKの申請支援現場での知見によると、採択後の取消パターンで最も多いのが「計画内容との乖離」です。「飲食店のHP作成」で採択されたにもかかわらず、別事業のHPを作成していたケースでは取消処分を受けています。

NG例3：同一補助金を連続で取得しようとする

同じ補助金への再申請は制度上可能な場合でも、審査で厳しく見られる傾向があります。

NG例4：交付決定前に発注・支払いをしてしまう

「採択」と「交付決定」は異なります。交付決定（採択後に交付申請を提出し、補助金事務局が審査して正式に交付を認める手続き）が下りる前に発注・支払いをした場合、その費用は補助対象外になります。

また、補助金を返還する事態が発生した場合、延滞金が加算されます。利率は年利3〜10.75%程度が設定されているケースが多く（各補助金の交付規程に基づく）、返還額が大きいほど負担も重くなります。

不採択だった場合はどうなるか？

不採択になっても、申請にかかった費用（採択前の支出）は事業者の自己負担です。採択前に補助事業のための発注・支払いをしている場合は補助金で回収できず、費用は全額自己負担となります。

一方、再申請は制度上可能です。ただし同一の申請内容をそのまま出し直しても採択される可能性は低く、不採択の理由を分析したうえで事業計画を見直すことが重要です。補助金HACKでは不採択後の再申請支援にも対応しています。LINEでご相談ください。

複数申請の申請順序はどう決めるべきか？

補助金を複数申請する場合、申請の優先順位とタイミング管理が採択率を左右します。

補助金HACKが申請支援の現場で確認してきた傾向として、年度始まり（4〜7月）の第1回公募は採択率が高い傾向があります（補助金HACKの支援実績から見た傾向であり、公式統計ではありません）。

申請順序を決める4つの判断軸

補助金を複数申請する正しい手順は次の4ステップです。

1. 締切が近い補助金を優先する：公募期間を逃すと次回公募まで数ヶ月〜1年待つことになります
2. 採択率が高い補助金を先に確保する：前掲の採択率早見表を参考に優先度を検討してください
3. 補助額が大きい補助金の事業計画を先に作る：事業計画書の作成に時間がかかるため、補助額の大きい補助金を優先的に仕上げるのが現実的です
4. 対象経費の重複がないか先に整理する：どの経費をどの補助金に割り当てるかを表で整理しておくと管理しやすくなります

書類作成にかかる時間コストの目安は？

複数申請を検討する際に見落とされがちなのが、書類作成にかかる時間・コストです（補助金HACKの支援実績に基づく目安）。

• 事業計画書（ものづくり補助金）：初回作成で40〜80時間程度
• IT導入補助金申請書類：10〜20時間程度
• 持続化補助金の経営計画書：20〜40時間程度

2補助金を同時申請する場合、整合性の確認・書類管理を含めると、合計100〜150時間以上を申請作業に充てるケースも少なくありません。成功報酬型の補助金支援サービスは一般的に補助額の10〜15%程度が相場で、採択されて初めて費用が発生します。100時間超の社内工数を削減しながら採択率向上も期待できるため、投資対効果で検討する経営者が増えています。

複数申請時のスケジュール管理例（製造業・2補助金同時申請の場合）

フェーズ	ものづくり補助金	IT導入補助金
公募確認・対象確認	第1週	第1週（同時）
経費の割り当て整理	第2週	第2週（同時）
事業計画書作成	第3〜6週	第3〜4週
申請書類の準備	第5〜7週	第4〜5週
申請・提出	締切に合わせる	締切に合わせる
採択通知	提出から1〜3ヶ月後	提出から1〜2ヶ月後
交付決定	採択後1〜2ヶ月後	採択後1ヶ月程度
事業実施・発注	交付決定後	交付決定後

補助金の申請から実際の入金まで、一般的に半年〜1年半かかります。複数申請をするとスケジュール管理の負担も増えるため、事前に進行表を作って管理することを推奨します。

専門家に頼むべきか、自分で申請すべきか？

「補助金の申請を自分でやるか、専門家に頼むか」は、投資額と社内リソースで判断するのが基本です。

判断軸	自分で申請に向いているケース	専門家への依頼が向いているケース
補助額の規模	50〜100万円程度の小規模	数百万〜1,000万円超
申請経験	過去に申請経験あり	初回または複数同時申請
社内工数	担当者に余裕がある	本業が繁忙・担当者がいない
事業計画の複雑さ	投資内容がシンプル	新分野展開・生産ライン刷新など複雑

持続化補助金のような小規模・書式が比較的シンプルな補助金は自己申請でも対応しやすいです。一方、ものづくり補助金のように事業計画書の審査ウェイトが高い補助金は、専門家のサポートで採択率が大きく変わる傾向があります（補助金HACKの支援実績に基づく見解）。

一般的な士業（行政書士・中小企業診断士）への依頼は着手金型が多いのに対し、補助金HACKの支援は採択されて初めて費用が発生する成功報酬型です。「採択されなかったのに費用だけかかった」というリスクを避けたい経営者の方に多く選ばれています。

補助金を複数申請するときの「よくある失敗」と対策

複数申請で起きやすい失敗には、共通したパターンがあります。

失敗1：AI（ChatGPT等）で全部書いて、複数書類の整合性が崩れる

複数の補助金を同時申請する場合、それぞれの事業計画書に書いている内容が矛盾していると、審査担当者に不信感を与えます。

対策：AIは各パート（自社概要・市場動向・補助事業内容など）ごとに活用し、複数書類間の整合性を最後に必ず人の目で確認することが重要です。

失敗2：採択済みのテンプレートを使い回す

「採択された資料を売ります」系の2次転売資料を購入して流用しても通らないというのは、現場でよく見られるパターンです。

対策：自社の具体的な数値・課題・強みを盛り込んだオリジナルの計画書を作成することが採択への近道です。

失敗3：添付書類の漏れ

複数の補助金を同時に申請していると、それぞれに必要な書類が異なるため、確認が追いつかなくなることがあります。

対策：補助金ごとにチェックリストを作成し、提出前に必ず確認する体制をつくることを推奨します。

補助金申請チェックリスト：提出前に必ず確認すべき項目

複数の補助金を申請する前に、以下のチェックリストで確認しましょう。

• 申請する補助金ごとに「対象経費」のリストを作成したか
• 複数の補助金で同一経費を申請していないか
• 各補助金の公募要領に「他の補助金との併用禁止」の記載がないか確認したか
• GビズIDプライム（政府が提供する法人・個人事業主向けの共通認証ID。多くの補助金電子申請に必須で、取得に2〜3週間かかる）を取得済みか
• 各補助金の締切日・交付決定予定日をカレンダーに記録したか
• 補助金ごとに「交付決定日以降にしか発注できない」というルールを担当者全員が理解しているか
• 各補助金の事業計画書で記載している事業内容に矛盾がないか
• 決算書・登記簿謄本・納税証明書など共通書類の有効期限を確認したか

詳細版チェックリスト（書類確認・採択後管理含む全項目）はLINEでPDFをお送りします。

チェックリストPDFと補助金診断をまとめて受け取りたい方は、以下からLINE登録してください。登録後、通常24時間以内にお届けします。

補助金の不採択の理由TOP5とは？採択事例との差

補助金HACKの支援現場で見た「複数申請時の不採択理由」に共通するパターンは次の5つです。

1. 書類間の整合性の欠如：複数申請時に事業計画書の内容が矛盾している
2. 交付決定前の発注・支払い：採択通知を受けて発注を急いでしまうケース
3. 添付書類の漏れ・期限切れ：決算書・登記簿謄本の有効期限を確認しないまま提出
4. AI生成テキストの整合性崩れ：複数書類をAIで一気に作成し、矛盾が生じる
5. 事業計画の具体性不足：補助金の目的と自社の投資計画が結びついていない

採択事例（匿名・製造業・ものづくり補助金 × IT導入補助金）：従業員20名の金属加工業。設備費（CNC旋盤）と生産管理システム費を明確に分けて申請。「現在の月産2,000個→補助事業後3,200個（160%）」と数値目標を明示し、投資回収期間を4.5年と試算した結果、採択。

不採択になる事業計画に共通する特徴：「〇〇を導入したい」という意欲は伝わるが、「なぜその投資が必要か」「導入後に何がどう変わるか」という具体的な根拠が薄い。特に投資回収期間の試算が抜けている計画書は審査で低評価になる傾向があります（補助金HACKの支援実績に基づく見解）。

自治体補助金と国補助金は組み合わせられるか？

国の補助金と都道府県・市区町村の補助金を組み合わせることは、対象経費が重複しなければ原則として可能です。

よくご質問いただくのが「ものづくり補助金と都道府県の設備補助を同時に使えるか」というケースです。対象機械が別々であれば、または同一機械でも補助対象経費を按分して申請できる自治体もあります。ただし自治体ごとに規定が異なるため、必ず地元の商工会・商工会議所または都道府県の担当窓口に確認してください。

また、自治体補助金は公募期間が短く、情報が出回りにくい傾向があります。補助金HACKのLINEでは、都道府県別の補助金情報も随時お届けしています。

まとめ：補助金の併用で中小企業が資金調達を最大化するには？

中小企業が補助金を複数同時に活用することは、ルールを理解したうえで進めれば十分可能です。

補助金は金額が大きくなるほど「事業計画の質」が採択の鍵になります。複数の補助金を同時に申請する場合は、それぞれの計画書の整合性と、スケジュール管理の徹底が特に重要です。

補助金HACKが選ばれる3つの理由

補助金HACKが選ばれる理由は、最新情報・スピード・実例の3点に集約されます。

申請支援実績800件・採択率80%（支援実績に基づく推計値）を支えるノウハウを以下で説明します。

1. 新制度への即時対応

補助金の公募要領・枠組み・補助率は毎年・毎公募回ごとに変更されます。補助金HACKでは、新公募要領の発表から最短で記事・情報を更新し、「古い情報を信じて損をする」リスクを最小化しています。2026年の新事業進出補助金・成長加速化補助金にも即時対応中です。

2. 成功報酬型で採択されるまで費用なし

一般的な士業への依頼は着手金型が多く、不採択でも費用が発生するケースがあります。補助金HACKは成功報酬型（採択されて初めて費用が発生）のため、リスクを抑えて専門家サポートを受けたい経営者に選ばれています。

3. 実例ベースのノウハウ

汎用的な制度解説だけでなく、実際の申請支援現場で見られたパターン・失敗事例・採択事例をもとにした情報を提供しています。「自分の会社に当てはまるか」という視点で読めるコンテンツを心がけています。

なお、お近くの商工会・商工会議所や、全国に展開するよろず支援拠点（中小企業庁が全国に設置する無料経営相談窓口）でも補助金の相談が可能です。補助金HACKのLINE相談と併用することで、より確実な情報収集ができます。

今週できる3ステップ：補助金活用をすぐに始めるには？

「補助金を使いたいが、何から始めればいいか分からない」という経営者の方に向けて、今週中に着手できる具体的な行動をまとめます。

1. LINEで業種・投資内容を送る：補助金HACKのLINEに「業種」「従業員数」「検討中の投資内容」を送るだけで、最適な補助金の組み合わせと概算補助額をお届けします。
2. 投資計画を表にまとめる：「何に・いくら・いつ投資するか」を一覧表で整理します。この表が、どの経費をどの補助金に割り当てるかを判断する基盤になります。
3. GビズIDプライムを申請する：GビズIDプライム（政府が提供する法人・個人事業主向けの共通認証ID）は、多くの補助金電子申請に必須です。取得に2〜3週間かかるため、早めに申請を済ませておくことが重要です。GビズIDプライム申請ページ（gBizID公式）から申請できます。

この3ステップを進めるだけで、補助金申請の準備が大きく前進します。

著者プロフィール

補助金HACK 編集部 中小企業の補助金活用を専門とする申請支援チーム。申請支援実績800件・採択率80%（支援実績に基づく推計値。母数：2020年〜2025年度の補助金HACKによる支援案件全件、採択件数÷申請件数で算出）。ものづくり補助金・IT導入補助金・持続化補助金をはじめ、2026年新設の成長加速化補助金・新事業進出補助金にも対応。最新の公募情報を随時更新中。

LINEで届く情報の例：

• 業種別の利用可能補助金一覧
• 投資内容に合わせた概算補助額の試算
• 申請スケジュール案（公募締切・交付決定予定日含む）
• チェックリストPDF（申請前・採択後の確認事項）

自社に使える補助金の組み合わせを個別に確認したい方は、LINEでご相談ください。通常24時間以内に担当者がご返信します。

参考資料

• 中小企業庁「中小企業施策利用ガイドブック」
• 中小企業庁「ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金」公募要領
• GビズID公式サイト（https://gbiz-id.go.jp/）
• 各補助金公式サイト（ものづくり補助金・IT導入補助金・小規模事業者持続化補助金・中小企業省力化投資補助金・業務改善助成金）

補助金情報確認日：2026年4月28日（各補助金の公募状況・補助率・上限額は公募回ごとに変更される場合があります。最新情報は各補助金の公式サイトおよび公募要領をご確認ください）

よくある質問

:::point[次に読みたい記事] 補助金活用は「申請して終わり」ではありません。次のステップでつまずきやすいポイントを先取りして解説しています。

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